应用化学专业始办于2009年，当年9月招收第一批本科生，目前在校生150人。本专业现有专任教师4人，其中副教授2人，博士2人，硕士2人。近五年，教师先后主持省部级课题3项，厅局级课题1项，院级课题3项；发表论文20多篇，其中核心期刊11多篇。
本专业既注重学生思想品德锻造、专业知识掌握，也注重学生知识面的拓宽和实践能力的培养。不仅学习化学方面的基础知识、基本理论、基本技能，还接受到基础研究和应用基础研究方面的科学思维和科学实验训练，具备运用所学知识和实验技能进行应用研究、技术开发和科技管理的基本技能。开设的主要课程有：无机化学、分析化学、有机化学、高等数学、仪器分析、物理化学、结构化学、高分子化学、精细化学品化学、食品化学、精细有机合成、化工制图、药物化学、化工原理、环境化学、工业分析、天然产物化学、精细化工工艺学、化学化工科技文献检索、计算机在化学化工中的应用等，成为学生专业知识、专业技能培养的强有力平台。
本专业注重学生专业技能培训，开展专业实训（2周）、化工见习（2周）、生产实习（2周）、专业实习（18周）等，充分培养了学生的专业技能。
本专业毕业生主要就职于南疆基础教育单位，以及各类药物生产企业、药物研究所、医药卫生行政管理部门从事新药研制、药品生产、管理及营销等工作；也有在农业、精细化工和生物化工等部门从事生产、新产品研制、各种原料及成品的分析测试等工作；还有从事化学工业领域的产品研制与开发、装置设计、生产过程的控制以及企业经营管理等方面的工作。本专业毕业生既具有扎实的基本理论知识，又是具有熟练的基本操作技能的应用型专门人才，得到用人单位的高度认可。
